Научно-исследовательская лаборатория экологической биохимии

Научно-исследовательская лаборатория экологической биохимии МГОУ создана 1 октября 2005 года.

Целями создания и деятельности лаборатории являлись разработка и продвижение в практику методов биологической индикации и экологического мониторинга, основанных на современных технологиях, существующих в области биохимии и молекулярной биологии, а также изучение на молекулярно-генетическом и биохимическом уровнях влияния абиотических и биотических факторов на биоценозы в экосистемах Московской области; расширение объема информации о состоянии окружающей среды в Московской области; обучение студентов МГОУ, аспирантов и стажеров биохимическим и молекулярно-биологическим методам мониторинга окружающей среды.

В 2006-2009 годах Лаборатория была аккредитована в «Системе лабораторий, осуществляющих санитарно-эпидемиологические исследования, испытания» с правом проведения работ по идентификации генно-инженерно-модифицированных организмов (ГМО) растительного происхождения.

Лаборатория экологической биохимии оснащена современным оборудованием, необходимым для проведения большинства биохимических и молекулярных исследований, в том числе по приоритетным направлениям развития науки, технологий и техники в Российской Федерации.

Лаборатория является лабораторной базой биолого-химического факультета МГОУ для проведения практических занятий для студентов, бакалавров и магистров по дисциплинам «Биохимия», «Молекулярная биология», «Основы биохимической экспертизы», «Определение ГМО». В проведении этих занятий принимают непосредственное участие сотрудники лаборатории. Кроме того, на базе лаборатории проводятся занятия со школьниками.

В настоящее время в лаборатории проводятся научные исследования по следующим направлениям:

  1. Молекулярно-генетический аспект экологического взаимодействия растений с фитопатогенами.
  2. Изучение биохимических аспектов адапивных процессов у пресноводных гидробионтов.
  3. Геномный и биохимический полиморфизм гидробионтов как критерий генетической адаптации.

Все эти направление имеют фундаментальный аспект, который состоит в изучении процессов взаимодействия организмов друг с другом и с условиями окружающей среды на молекулярном и биохимическом уровнях. Кроме того, данные исследования имеют и прикладное значение, так как полученные в них данные могут использоваться в природоохранной практике для оценки степени загрязненности природных и сточных вод, а также в практике сельского хозяйства для борьбы с заболеваниями сельскохозяйственных культур. Прикладное значение выполняемых работ подтверждено патентами, полученными сотрудниками лаборатории на результаты своих исследований. Все полученные результаты могут быть применены на практике в условиях Московской области, так как объектами исследований являются организмы, распространенные на территории Московской области и прилегающих к ней областей Российской Федерации.

В лаборатории выполнялись исследования, поддержанные следующими грантами:

  1. Грант РФФИ 18-016-00144 А «Структурные и функциональные особенности генов вирулентности у штаммов возбудителя фитофтороза Phytophthora infestans, собранных на Европейской территории России» (Номер в ЦИТиС АААА-А18-118011690189-3).
  2. ФЦП: НИР на тему «Изучение фитопатогенного гриба Cryphonectria parasiticа – возбудителя крифонекроза каштана благородного (Castanea sativa) – на территории Северо-Западного Кавказа» (Гос.контракт П624).
  3. по программе Президента РФ для поддержки молодых ученых и научных школ: для молодых докторов на тему «Геномный и биохимический полиморфизм гидробионтов как критерии внутривидовой дифференциации в ответ на воздействие факторов внешней среды» (договор №16.120.11.1168-MД).

Сотрудниками лаборатории были получены следующие патенты:

  1. Патент РФ №2308719 «Способ определения токсического загрязнения сточных и природных пресных вод» (Цветков И.Л., Попов А.П., Коничев А.С.).
  2. Патент Турции №ТР 2008 07145 В «Kestane dokularinda Criphonectria parasitica mantarin ekspres teshis metodu [Экспресс метод диагностики болезни каштана, вызванной Criphonectria parasitica]» (Аллахвердиев С.Р., Гюндюз Гёкхан, Попов А.П., Коничев А.С., Кырдар Эрол, Белов А.А., Цветков И.Л., Атик Г. Атилла).
  3. Патент РФ № 2422533 «Способ идентификации фитопатогенного гриба Criphonectria parasitica и диагностика крифонекроза (эндотиевого рака) каштана методом ПЦР» (Попов А.П., Цветков И.Л., Коничев А.С., Белов А.А., Аллахвердиев С.Р.).

Основные публикации по темам исследований

Chizhik V.K., Martynov V.V., Sokolova E.A., Kuznetsova M.A., Rogozina E.V., Khavkin E.E. The repertoire of Avr genes in Phytophthora infestans lines that colonize potato plants in the VIR genetic collection (Pushkin, St. Petersburg). In: Schepers H.T.A.M. (ed.) PAGV-Special Report, Wageningen, DLO Foundation, no. 19, P. 159-166.

Martynov V. Chizhik, V., Sokolova, E., Kuznetsova, M., Khavkin, E. Polymorphism of avirulence genes in potato late blight pathogen Phytophthora infestans as characterized by SSCP analysis //Agri Gene. – 2019. – С. 100093.

Martynov V.V., Chizhik V.K., Sokolova E.A., Kuznetsova M.A., Ulanova T.I., Khavkin E.E., 2019. Rapid discrimination of Phytophthora infestans (a)virulence genes by SSCP analysis.In: Schepers H.T.A.M. (ed.) PAGV-Special Report, Wageningen, DLO Foundation, no. 19, P. 259-267.

Бадулина И.А., Мартынов В.В. Влияние различных способов предварительной обработки растительного материала на качество выделяемой из него геномной ДНК. // Вестник МГОУ. Серия Естественные науки. 2014. №3. С. 6–10.

Дроганов Е.И., Поликарпова Л.В., Дроганова Т.С., Цветков И.Л., Коничев А.С. Биохимический и молекулярный полиморфизм в популяциях речной живородки (Viviparus vivipsrus L.) // Вестник МГОУ. Серия Естественные науки. 2014. №2. С. 20–29.

Дроганов Е.И., Цветков И.Л., Коничев А.С. Биохимические основы адаптации организмов // Биология в школе. 2014. №6. С. 10-14.

Дроганова Т.С., Поликарпова Л.В., Цветков И.Л. Метаболическая адаптация речной живородки Viviparus vivipsrus L. к сублетальному токсическому воздействию тяжелых металлов. // Вестник МГОУ. Серия Естественные науки. 2014. №4. С. 22–27.

Коничев А.С., Попов А.П., Цветков И.Л., Филков П.В. Ферменты как биохимические маркеры загрязнения воды. // Приложение к Вестнику МГОУ. Серия «Естественные науки». География, экология, экономика: актуальные проблемы науки и образования. М.: Изд–во МГОУ, 2005. С. 151–153.

Мартынов В.В., Цветков И.Л., Хавкин Э.Е. Ортологи гена арабидопсиса CLAVATA1 у культурных форм Brassicaceae. // Онтогенез. 2004. Т. 35, №1. С. 41–46 (нет).

Попов А.П., Белов А.А., Иванушкина Н.Е., Цветков И.Л., Коничев А.С. Молекулярно-генетические детерминанты внутривидового полиморфизма фитпатогенного гриба Cryphonectria parasitica. // Генетика. 2011. Т. 47, №3. С. 301–311.

Попов А.П., Белов А.А., Цветков И.Л., Коничев А.С. Исследование полиморфизма Cryphonectria parasitica – возбудителя крифонекроза каштана посевного на Северо-Западном Кавказе. // Вестник МГОУ. Серия Естественные науки. 2010. №3. С. 99–104.

Попов А.П., Коничев А.С., Цветков И.Л. Влияние токсичных соединений техногенного происхождения на активность и множественные формы кислой ДНКазы живородки речной  (Viviparus viviparus L.). // Прикладная биохимия и микробиология. 2003. Т. 39. №5. С. 518–523.

Попов А.П., Цветков И.Л., Белов А.А., Коничев А.С., Иванушкина Н.Е., Кочкина Г.А., Озерская С.М. Молекулярно-генетическая идентификация фитопатогенного гриба Cryphonectria parasitica. // Микробиология. 2010. Т. 79, №2. С. 246–251.

Попов А.П., Цветков И.Л., Коничев А.С. Биохимическое тестирование токсического загрязнения вод: планирование эксперимента и выбор тест–объекта. // Вестник МГОУ. Серия Естественные науки. 2006. № 4. С. 87–92.

Попов А.П., Цветков И.Л., Коничев А.С. Использование водных беспозвоночных для определения токсического загрязнения вод. // Биология в школе. 2010. №3. С. 42–45.

Попов А.П., Цветков И.Л., Коничев А.С. Разделение и характеристика дезоксирибонуклеаз гепатопанкреаса живородки речной в норме и при модельной интоксикации in vivo. // Биохимия. 2008. Т. 73. Вып. 8. С. 1161–1167.

Сеитова А.М., Игнатов А.Н., Супрунова Т.П., Цветков И.Л.,
Дейнеко Е.В., Дорохов Д.Б., Шумный В.К., Скрябин К.Г. Оценка генетического разнообразия дикорастущей сои (Glycine soja Siebold et Zucc.) в Дальневосточном регионе России. // Генетика. 2004. Т. 40, №2. С. 224–231.

Цветков И.Л. Анализ распределения микросателлитной днк и причин внутривидового полиморфизма моллюсков. // Вестник МГОУ. Серия Естественные науки. 2011. №5. С. 24–26.

Цветков И.Л. Биохимический аспект реакции гидробионтов на интоксикацию. Saarbrücken: Lambert Academic Publishing GmbH & Co. KG, 2011. 321 c.

Цветков И.Л., Зарубин С.Л., Урванцева Г.А., Коничев А.С., Филиппович Ю.Б. Кислая фосфатаза гидробионтов как фермент–индикатор биохимической адаптации к воздействию токсических веществ. // Известия АН. Серия биологическая. 1997. №5. С. 539–545.

Цветков И.Л., Коничев А.С. Стресс–индуцированная динамика сорбита и активности сопутствующих ферментов в пищеварительной железе живородки речной. // Биохимия. 2009. Т. 74. Вып. 11. С. 1548–1554.

Цветков И.Л., Поликарпова Л.В., Коничев А.С. Новый метод количественного определения активности дезоксирибонуклеазы с использованием флуресцентно-меченых олигонуклеотидов в качестве субстрата. // Вестник МГОУ. Серия Естественные науки. 2012. №3. С. 46–51.

Цветков И.Л., Попов А.П., Коничев А.С. Активность кислой фосфатазы и дезоксирибонуклеазы у гидробионтов под влиянием различных токсических веществ водной среды. // Гидробиол. журнал. 2012. Т. 48, №1. С. 95–108.

Цветков И.Л., Попов А.П., Коничев А.С. Комплекс кислых фосфатаз живородки речной в норме и при интоксикации ионами кадмия. // Биохимия. 2003. Т. 68. Вып. 12. С. 1648–1656.

Цветков И.Л., Цветкова М.А., Зарубин С.Л., Семерной В.П., Коничев А.С. Оценка качества сточных и природных вод с помощью биохимического показателя — активности кислой фосфатазы пресноводных моллюсков. // Водные ресурсы. 2006. Т. 33. №1. С. 62–70.

Цветкова М.А., Цветков И.Л., Коничев А.С. Содержание гликоалкалоидов и состав белков в листьях картофеля при повреждении колорадским жуком. // С.–х. биология. Серия: Биология растений. 2004. №1. С. 97–104.

Чижик В.К., Мартынов В.В. Полиморфизм гена Avr2 оомицета Phytophthora infestans (Mont.) de Bary в популяции Московской области. Генетика, 2017. Т. 53. № 12, с. 1412-1419

Чижик В.К., Соколова Е.А., Мартынов В.В., Кузнецова М.А., Хавкин Э.Е. Распознавание штаммов возбудителя фитофтороза картофеля Phytophthora infestans методом SSCP анализа генов вирулентности. Биотехнология, 2018. Т. 34. № 6. С. 4-11. DOI: 10.21519/0234-2758-2018-34-6-4-11